Après la formation de trois promotions (la dernière est celle de juin 2008) en Diplôme Universitaire en Technologies (DUT), l’ISSBAT assure actuellement, dans le cadre du système LMD et dans le domaine des Sciences et Technologies, une formation en Licence Appliquée dans deux Mentions : « Biotechnologie » et « Protection de l’Environnement »

Elle assure aussi une formation en mastère professionnel dans deux Mentions :

1- « Technologies de vivant et de l’environnement » :
       - Parcours : Génie Biologique
       - Parcours : Génie de l’Environnement

2-  « Management du Risque et Cindyniques» :
     - Parcours :Management du Risque en Biotechnologie         
      
    -  Parcours : Management du Risque en Environnement